שימוש בשפת R לניתוח סטטיסטי של נתונים באקולוגיה ובמדעי הסביבה

Transcription

1 סילבוס שימוש בשפת R לניתוח סטטיסטי של נתונים באקולוגיה ובמדעי הסביבה תאריך עדכון אחרון נקודות זכות באוניברסיטה העברית: 2 תואר:מוסמך היחידה האקדמית שאחראית על הקורס:איכות הסביבה ומשאבי טבע בחקלאות השנה הראשונה בתואר בה ניתן ללמוד את הקורס: 0 סמסטר:סמסטר א' שפת ההוראה:אנגלית קמפוס: רחובות מורה אחראי על הקורס (רכז):פרופ משה קול דוא"ל של המורה האחראי על הקורס: moshe.coll@mail.huji.ac.il שעות קבלה של רכז הקורס:בתאום מורי הקורס: ד"ר Wajnberg Eric 1 / 5

2 פרופ משה קול תאור כללי של הקורס: שימוש בשפת R לניתוח סטטיסטי של נתונים אקולוגיים, סביבתיים והתנהגותיים; ניהול נתונים, סטטיסטיקה תיאורית, הצגה גרפית של נתונים, דגמי פיזור, בחינת השערות השוואת ממוצעים, יחסי גומלין בין שני משתנים (קורלציה, רגרסיה, טבלת אפשרויותcontingency table ועוד), סטטיסטיקה לא-פרמטרית,,GLM ניתוחי הישרדות, רגרסיה לוגיסטית, רגרסיה לוג-ליניארית, ועוד. מטרות הקורס: מטרת הקורס יהא להקנות ידע וכלים בשימוש בשפת R לניתוח סטטיסטי של נתונים אקולוגיים, סביבתיים והתנהגותיים; תוצרי למידה בסיומו של קורס זה, סטודנטים יהיו מסוגלים: להשתמש בתוכנת R כדי: לארגן נתונים לזהות מגמות בנתונים להציג נתונים באופן גראפי ליישם מבחנים סטטיסטיים לבחינת היפותזות דרישות נוכחות (%): 100 שיטת ההוראה בקורס:הרצאות ותרגילים רשימת נושאים / תכנית הלימודים בקורס:. 1 ללמוד כיצד להשתמש בתוכניות מחקר R: כיצד להוריד ואיך להתקין אותן ; הכרת ממשק המשתמש ; תחביר בסיסי ; יבוא נתונים ; עזרה ותיעוד ; גרפיקה; פונקציות, חבילות וכו '. 2 מבוא לסטטיסטיקה : המטרה, תכלית, טרמינולוגיה.. 3 שימוש ב- R לסטטיסטיקה תאורית : ייצוג גרפי, הפצות, פרמטרים לתיאורמדגם ) ממוצע, שונות, וכו ').. 4 שימוש ב- R כדי לבדוק אחד או שני ממוצעים : הנחות ומגבלות, השוואת ממוצע לערך תאורת, השוואה בין שני ערכי ממוצע המגיעים משני מדגמים בלתי תלויים או תלויים.. 5 שימוש ב- R כדי להשוות יותר משני ממוצעים : מבוא לניתוח בכיוון אחד של שונות ) ANOVA (,.משמעותיים הבדלים מחפשים, homoscedasticity. 6 שימוש ב- R לבדיקת קשר בין שני משתנים: שני משתנים כמותיים : מתאם קו הרגרסיה, ; שני משתנים איכותיים : טבלת מגירוצ'י ; השוואת אחוזים שימוש ב- R עבור בדיקות שאינן פרמטריות : בדיקות להשוואת ממוצעים : Wilcoxon Mann - חנית דרגת מתאם, Wilcoxon דרגה חתמה מבחן : דגימות תאום ; ארהב - קרוסקל, Whitney 2 / 5

3 . 8 שמוש ב- R עבור מודלים ליניארים כלליים : דגמים ליניארים כללים וניתוח שרידות ; רגרסיית לוג ולוג לינארי ; Meier-Kaplan חומר חובה לקריאה: - חומר לקריאה נוספת: r_2011/handouts_4up_september_2011.pdf Brian Dennis. The R Student Companion. Chapman & Hall/CRC Press, Boca Raton, FL, ISBN [ bib Discount Info ] Pierre-Andre Cornillon. R for Statistics. Chapman & Hall/CRC Press, Boca Raton, FL, ISBN [ bib Discount Info ] Paul Teetor. 25 Recipes for Getting Started with R. O'Reilly, ISBN [ bib ] Paul Murrell. R Graphics, Second Edition. Chapman & Hall/CRC the R series. Chapman & Hall/CRC Press, Boca Raton, FL, ISBN [ bib Discount Info ] Hrishi Mittal. R Graphs Cookbook. Packt Publishing, ISBN [ bib ] Benjamin M. Bolker. Ecological Models and Data in R. Princeton University Press, ISBN [ bib Publisher Info ] Claus Thorn Ekstrom. The R Primer. Chapman & Hall/CRC Press, Boca Raton, FL, ISBN [ bib Discount Info ] John M. Quick. The Statistical Analysis with R Beginners Guide. Packt Publishing, ISBN [ bib beginners-guide/book ] Carlo Gaetan and Xavier Guyon. Spatial Statistics and Modeling. Springer Series in Statistics. Springer, ISBN [ bib Discount Info Publisher Info ] Hrishikesh D. Vinod, editor. Advances in Social Science Research Using R. Lecture Notes in Statistics. Springer, ISBN [ bib Discount Info Publisher Info ] Victor Bloomfield. Computer Simulation and Data Analysis in Molecular Biology and Biophysics: An Introduction Using R. Springer, ISBN [ bib ] 3 / 5

4 Richard M. Heiberger and Erich Neuwirth. R Through Excel. Use R. Springer, ISBN [ bib Discount Info Publisher Info ] Additional: Yihui Xie. Dynamic Documents with R and knitr. Chapman & Hall/CRC, ISBN [ bib Publisher Info ] Robert J Knell. Introductory R: A Beginner's Guide to Data Visualisation and Analysis using R. March ISBN [ bib ] Joseph Hilbe. Methods of Statistical Model Estimation. Chapman & Hall/CRC Press, Boca Raton, FL, ISBN [ bib Discount Info ] Din Chen. Applied Meta-Analysis with R. Chapman & Hall/CRC Biostatistics series. Chapman & Hall/CRC Press, Boca Raton, FL, ISBN [ bib Discount Info ] Sarah Stowell. Instant R: An Introduction to R for Statistical Analysis. Jotunheim Publishing, ISBN [ bib ] Michael Lawrence. Programming Graphical User Interfaces in R. Chapman & Hall/CRC the R series. Chapman & Hall/CRC Press, Boca Raton, FL, ISBN [ bib Discount Info ] Dimitris Rizopoulos. Joint Models for Longitudinal and Time-to-Event Data, with Applications in R. Chapman & Hall/CRC, Boca Raton, ISBN [ bib Publisher Info ] Laura Chihara and Tim Hesterberg. Mathematical Statistics with Resampling and R. Wiley, 1st edition, ISBN [ bib Publisher Info ] John Fox and Sanford Weisberg. An R Companion to Applied Regression. Sage Publications, Thousand Oaks, CA, USA, second edition, ISBN [ bib ] Bruno Falissard. Analysis of Questionnaire Data with R. Chapman & Hall/CRC Press, Boca Raton, FL, ISBN [ bib Discount Info ] Chris Hay Jahans. R Companion to Linear Models. Chapman & Hall/CRC Press, Boca Raton, FL, ISBN [ bib Discount Info ] Damon M. Berridge. Multivariate Generalized Linear Mixed Models Using R. Chapman & Hall/CRC Press, Boca Raton, FL, ISBN [ bib Discount Info ] Robert A. Muenchen. R for SAS and SPSS Users. Springer Series in Statistics and Computing. Springer, ISBN [ bib Discount Info Publisher Info ] Paul S. P. Cowpertwait and Andrew Metcalfe. Introductory Time Series with R. Springer Series in Statistics. Springer, ISBN [ bib Discount Info Publisher Info ] 4 / 5

5 Powered by TCPDF ( הערכת הקורס - הרכב הציון הסופי: מבחן מסכם בכתב/בחינה בעל פה % 0 הרצאה 0 % השתתפות % 0 הגשת עבודה % 0 הגשת תרגילים % 0 הגשת דו"חות % 0 פרויקט מחקר % 0 בחנים % 0 אחר % 100 הערכת מורה מידע נוסף / הערות: - 5 / 5